部分通訊作者、第一作者SCI期刊論文：
1. Zhu F, Yin ZT, Wang Z, Smith J, Zhang F. et al. Three chromosome-level duck genome assemblies provide insights into genomic variation during domestication, Nature Communications, 10,2021.（通訊作者）
2. Yin Z, Lian L, Zhu F, Zhang ZH, Hincke M, Yang N, Hou ZC: The transcriptome landscapes of ovary and three oviduct segments during chicken (Gallus gallus) egg formation. GENOMICS 2020, 112(1):243-251.（通訊作者）
3. Zhu F, Cui QQ, Yang YZ, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: Genome-wide association study of the level of blood components in Pekin ducks. GENOMICS 2020, 112(1):379-387. （通訊作者）
4. Deng MT, Zhu F, Yang YZ, Yang FX, Hao JP, Chen SR, Hou ZC: Genome-wide association study reveals novel loci associated with body size and carcass yields in Pekin ducks. BMC GENOMICS 2019, 20(1):1. （通訊作者）
5.Ding S, Li G, Chen S, Zhu F, Hao J, Yang F, Hou Z: Comparison of carcass and meat quality traits between lean and fat Pekin ducks. Asian-Australas J Anim Sci 2019. （通訊作者）
6. Wang Z, Yin ZT, Zhang F, Li XQ, Chen SR, Yang N, Porter TE, Hou Z: Dynamics of transcriptome changes during subcutaneous preadipocyte differentiation in ducks. BMC GENOMICS 2019, 20(1):688. （通訊作者）
7. Xing K, Zhao X, Ao H, Chen S, Yang T, Tan Z, Wang Y, Zhang F, Liu Y, Ni H et al: Transcriptome analysis of miRNA and mRNA in the livers of pigs with highly diverged backfat thickness. Sci Rep 2019, 9(1):16740. （通訊作者）
8. Yan W, Sun C, Zheng J, Wen C, Ji C, Zhang D, Chen Y, Hou Z*, Yang N*: Efficacy of Fecal Sampling as a Gut Proxy in the Study of Chicken Gut Microbiota. FRONT MICROBIOL 2019, 10:2126. （共同通訊作者）
9. Yin ZT, Zhu F, Lin FB, Jia T, Wang Z, Sun DT, Li GS, Zhang CL, Smith J, Yang N et al: Revisiting avian 'missing' genes from de novo assembled transcripts. BMC GENOMICS 2019, 20(1):4. （通訊作者）
10. Yin Z, Zhang F, Smith J, Kuo R, Hou ZC: Full-length transcriptome sequencing from multiple tissues of duck, Anas platyrhynchos. SCI DATA 2019, 6(1):275. （通訊作者）
11. Zhu F, Cheng SR, Yang YZ, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: Genome-Wide Association Study of Growth and Feeding Traits in Pekin Ducks. FRONT GENET 2019, 10:702. （通訊作者）
12. Zhu F, Zhang F, Hincke M, Yin ZT, Chen SR, Yang N, Hou ZC: iTRAQ-Based Quantitative Proteomic Analysis of Duck Eggshell During Biomineralization. PROTEOMICS 2019, 19(11):e1900011. （通訊作者）
13. Hou Z, An L, Han J, Yuan Y, Chen D, Tian J: Revolutionize livestock breeding in the future: an animal embryo-stem cell breeding system in a dish. J Anim Sci Biotechnol 2018, 9:90. （通訊作者）
14. Lin FB, Zhu F, Hao JP, Yang FX, Hou ZC: In vivo prediction of the carcass fatness using live body measurements in Pekin ducks. Poult Sci 2018, 97(7):2365-2371. （通訊作者）
15. Wu Y*, Zhang Y*, Hou Z*, Fan G, Pi J, Sun S, Chen J, Liu H, Du X, Shen J et al: Population genomic data reveal genes related to important traits of quail. GIGASCIENCE 2018, 7(5). （共同第一作者）
16. Liu L, Fan Y, Zhang Z, Yang C, Geng T, Gong D, Hou Z, Ning Z: Analysis of gene expression and regulation implicates C2H9orf152 has an important role in calcium metabolism and chicken reproduction. ANIM REPROD SCI 2017, 176:1-10. （通訊作者）
17. Zhu F, Gao Y, Lin F, Hao J, Yang F, Hou Z: Systematic analysis of feeding behaviors and their effects on feed efficiency in Pekin ducks. J Anim Sci Biotechnol 2017, 8:81. （通訊作者）
18. Jin S, Zhu F, Wang Y, Yi G, Li J, Lian L, Zheng J, Xu G, Jiao R, Gong Y et al: Deletion of Indian hedgehog gene causes dominant semi-lethal Creeper trait in chicken. Sci Rep 2016, 6:30172. （共同通訊作者）
19. Xing K, Zhu F, Zhai L, Chen S, Tan Z, Sun Y, Hou Z*, Wang C*: Identification of genes for controlling swine adipose deposition by integrating transcriptome, whole-genome resequencing, and quantitative trait loci data. Sci Rep 2016, 6:23219. （共同通訊作者）
20. Xing K, Zhu F, Zhai L, Liu H, Wang Y, Wang Z, Chen S, Hou Z*, Wang C*: Integration of transcriptome and whole genomic resequencing data to identify key genes affecting swine fat deposition. PLOS ONE 2015, 10(4):e122396. （共同通訊作者）
21. Zhu F, Yuan JM, Zhang ZH, Hao JP, Yang YZ, Hu SQ, Yang FX, Qu LJ, Hou ZC: De novo transcriptome assembly and identification of genes associated with feed conversion ratio and breast muscle yield in domestic ducks. ANIM GENET 2015, 46(6):636-645. （通訊作者）
22. Sui L, An L, Tan K, Wang Z, Wang S, Miao K, Ren L, Tao L, He S, Yu Y et al: Dynamic proteomic profiles of in vivo- and in vitro-produced mouse postimplantation extraembryonic tissues and placentas. BIOL REPROD 2014, 91(6):155. （共同通訊作者）
23. Xing K, Zhu F, Zhai L, Liu H, Wang Z, Hou Z*, Wang C*: The liver transcriptome of two full-sibling Songliao black pigs with extreme differences in backfat thickness. J Anim Sci Biotechnol 2014, 5(1):32. （共同通訊作者）
24. Zhang Q, Liu L, Zhu F, Ning Z, Hincke MT, Yang N, Hou Z: Integrating de novo transcriptome assembly and cloning to obtain chicken Ovocleidin-17 full-length cDNA. PLOS ONE 2014, 9(3):e93452. （通訊作者）
中文核心期刊：
1. 侯卓成.水禽育種技術以及自主化品種培育研究進展[J].養禽與禽病防治,2019(06):32-35.
2. 楊宇澤,侯卓成,常卓,張權.北京鴨群體遺傳多樣性及遺傳資源分析[J].中國畜牧雜志,2019,55(05):35-40.
3. 林芳斌,崔倩倩,袁建敏,侯卓成.不同能蛋水平免填飼料對北京鴨皮脂性能的影響及性狀相關分析[J].中國家禽,2016,38(14):22-26.
4. 朱峰,王炎耘,郝金平,張金奉,楊宇澤,楊方喜,陳瑤,胡勝強,侯卓成.北京鴨骨質量性狀和屠體性狀的相關性研究[J].中國畜牧雜志,2015,51(23):1-5.
5. 王炎耘,郝金平,李國程,袁建敏,楊方喜,陳瑤,胡勝強,侯卓成.日糧中添加不同比例纖維素對北京鴨生產性能的影響[J].中國家禽,2015,37(22):35-37.
6. 朱峰,王炎云,郝金平,楊宇澤,李國臣,楊方喜,陳瑤,胡勝強,侯卓成.超聲波法測量北京鴨皮脂性狀及其與屠宰性狀的相關分析[J].中國家禽,2015,37(16):6-9.
7. 侯卓成. 我國水禽育種研究綜述[N]. 中國畜牧獸醫報,2014-11-16(012).
8. 侯卓成. 養殖模式決定水禽育種方向[N]. 中國畜牧獸醫報,2014-11-16(012).
9. 邊蓓蕾,郝金平,楊方喜,胡勝強,侯卓成.北京鴨采食行為及其剩余采食量與部分經濟性狀的相關研究[J].中國家禽,2014,36(16):8-11.
10. 任康,張權,肖煒,云鵬,寧中華,侯卓成.利用微衛星標記分析不同保種場的保種效果[J].黑龍江動物繁殖,2014,22(03):8-14.
會議論文：
1. 鄧夢婷. 全基因組關聯分析鑒定與北京鴨體尺和屠體性狀相關的基因座[C]. 中國畜牧獸醫學會.中國畜牧獸醫學會2018年學術年會禽病學分會第十九次學術研討會論文集.中國畜牧獸醫學會:中國畜牧獸醫學會,2018:257.
2. 王政. 北京鴨皮腹部前脂肪細胞分化及增殖能力的差異比較[C]. 中國畜牧獸醫學會.中國畜牧獸醫學會2018年學術年會禽病學分會第十九次學術研討會論文集.中國畜牧獸醫學會:中國畜牧獸醫學會,2018:270.
3. 王政. 北京鴨皮下前脂肪細胞分化的轉錄組學初步分析[C]. 中國畜牧獸醫學會.中國畜牧獸醫學會2018年學術年會禽病學分會第十九次學術研討會論文集.中國畜牧獸醫學會:中國畜牧獸醫學會,2018:271.
4. 王政. 北京鴨腹部前脂肪細胞永生化模型的初步建立[C]. 中國畜牧獸醫學會.中國畜牧獸醫學會2018年學術年會禽病學分會第十九次學術研討會論文集.中國畜牧獸醫學會:中國畜牧獸醫學會,2018:283.
5. 丁思然. 烤炙型北京鴨與分割型北京鴨血清血脂指標比較[C]. 中國畜牧獸醫學會.中國畜牧獸醫學會2018年學術年會禽病學分會第十九次學術研討會論文集.中國畜牧獸醫學會:中國畜牧獸醫學會,2018:292.